胰蛋白胨是许多异养微生物的优良氮源，用于细菌的培养、分离、增殖、鉴定

胰蛋白胨还能够检测罐头食品中的“平酸”或硫化物酸败细菌，

所以也可用于无菌测试培养基，以及厌氧菌培养基等细菌生化特性试验用培养基的配置。

胰蛋白胨还广泛应用于高品质的抗生素、胞外蛋白、干扰素、白喉类毒素、

维生素等医药工业，氨基酸、有机酸、酶制剂、黄原胶等发酵工业，

生化制品及微生物学科研等领域中。